我们公司是综合工时制。公司扣我缺勤工资合法

公司扣缺勤工资需视具体情况，若扣三倍则不合法。依据《劳动争议调解仲裁法》，公司应合理扣工资，否则劳动者可维权。不及时处理可能导致劳动者权益受损，引发劳动纠纷。
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公司扣工资不合法时，劳动者可通过多种途径维权。投诉劳动行政部门、申请调解、申请仲裁、提起诉讼等都是常见方式。选择时应考虑效率与成本，优先尝试调解，无果后再考虑仲裁或诉讼。
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公司扣工资不合法。操作如下：1.首先与公司沟通，了解扣工资原因；2.若沟通无果，向劳动行政部门投诉，请求介入调查；3.也可向调解组织申请调解，寻求和解；4.调解不成，则向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；5.对仲裁裁决不服，可向人民法院提起诉讼，维护自身权益。